Nat Commun|用于药物发现的人工智能加速虚拟筛选平台
然而,尽管超大化学库筛选有很多优势,但成功的案例仍然有限。 该文介绍了一种基于结构的虚拟筛选方法RosettaVS,并开发了一个AI加速的开源虚拟筛选平台(OpenVS),能高效筛选数十亿化合物库。 作者在七天内成功筛选出针对两个靶标的多个命中化合物,通过X射线晶体学验证了对接结果。
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Nat Commun|广州超算发布EModelX,超智融合赋能冷冻电镜蛋白结构建模
七年前,诺贝尔化学奖也同样表彰了在难结晶蛋白等大分子复合物结构测定上取得突破的冷冻电镜技术。 为此, 国家超算广州中心杨跃东教授团队依托“天河二号”,利用智算融合两项诺奖技术,开发了一种创新的冷冻电镜蛋白结构建模方法“EModelX” , 相关研究成果近日在国际顶尖学术期刊《Nature Communications》上发表。 冷冻电镜 (cryo-EM) 技术被广泛用于蛋白质结构测定。
智药邦
Nat Commun丨揭示组氨酸甲基化辅助U2AF1执行剪接功能的关键作用
蛋白质甲基化作为一种关键的翻译后修饰,在多种生理过程中扮演着重要角色。 为了研究组氨酸甲基化修饰的生物学功能,研究人员以CARNMT1底物蛋白U2AF1为切入口,通过对CARNMT1 KO细胞与U2AF1 KD细胞的RNA-seq,发现甲基化的缺失会导致大量U2AF1相关的可变剪接事件的发生。 分子模拟结果显示,组氨酸甲基化修饰有助于维持锌指结构的稳定性,提示该修饰是调控锌指蛋白活性的一种普遍机制。
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Nat Commun丨张敏实验室揭示重症冠状病毒导致过度炎症的分子靶点
重症冠状病毒 (SARS-COV2,SARS-COV和MERS) 感染造成重症和死亡的重要原因之一是炎症因子大量释放导致的宿主的过度炎症反应甚至细胞因子风暴 【1】 。 虽然自新冠病毒爆发以来已有诸多相关研究,但是新冠病毒的生物学特性尤其是新冠病毒以及其它重症冠状病毒如何导致宿主产生过度炎症并没有明确。 因此,解读冠状病毒诱导宿主炎症风暴的分子机理,并获得药物靶向该过程可有效降低重症和致死率。
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