TMT和 iTRAQ等重同位素标记技术已广泛用于蛋白质组定量分析，为研究组织发育和疾病进程中的蛋白质表达变化提供了基础。 现有的蛋白质组差异分析工具主要面向两个或两组样本之间比较，能做多样本比较的工具还不多。 尤其是这些平台生成的蛋白质组数据往往包含强烈的批次效应，导致能够整合多个质谱实验批次数据开展定量比较分析的工具更是匮乏，局限了它们在大规模生物样本分析中的应用。
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