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Immunity项目文章 | Notch信号调节代谢功能障碍相关脂肪性肝病中巨噬细胞介导的炎症

脂肪性肝病 Immunity项目


肝巨噬细胞包括库普弗细胞和单核细胞源性巨噬细胞,在肝脏疾病中发挥着多种作用。然而,它们在MASLD/MASH中分化和功能的机制尚不清楚。

2024年9月,上海交通大学医学院上海市免疫学研究所Florent Ginhoux教授与苏冰教授团队联合在Immunity杂志在线发表了题为“Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease”的研究论文。该研究利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)绘制肝巨噬细胞命运图谱,揭示了单核细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞亚群在MASH中的时空动态。其中,免疫球蛋白kappa J区(RBPJ)信号通路notch-重组信号结合蛋白在控制单核细胞向巨噬细胞转变中具有关键作用,RBPJ缺乏会减弱炎症性巨噬细胞和单核细胞来源的KC分化,反过来促进保护性Ly6Clo单核细胞的出现。研究结果阐明Notch-RBPJ信号在单核细胞向巨噬细胞转化中的关键作用,并将有助于设计MASH治疗策略。

模式图(Credit: Immunity)

新格元在该研究中提供了GEXSCOPE®单细胞转录组建库试剂盒。



技术路线


单细胞研究结果

1.RBPJ调节单核细胞来源的巨噬细胞分化

为了解MASH中单核细胞和巨噬细胞群体是如何通过Notch信号调控的分子机制,对ND与MCDD喂养的WT和Lyz2CreRbpjfl/fl小鼠富集巨噬细胞进行单细胞转录组测序(scRNA-seq),并整合了WD诱导的MASH或MASLD公开单细胞数据集。鉴定出9个单核细胞和巨噬细胞亚群。包括2个单核细胞亚群,分别为Ly6Chi和Ly6Clo,前者高表达Ly6c2、S100a8、S100a9、Vcan、Sell和Thbs1,后者高表达Ace、Klf4和Ear2。3个KCs亚群,Timd4+KCs,Timd4-KCs和增殖的KCs。四个巨噬细胞亚群:Clec4e+巨噬细胞,C1qc+巨噬细胞,Spp1+巨噬细胞和荚膜巨噬细胞(图1A,B)。

比较ND与MCDD,发现MCDD的ResKCs丰度降低,Ly6Chi单核细胞、MoKCs和巨噬细胞增加。ND中RBPJ缺失导致ResKCs减少,但Ly6Chi和Ly6Clo单核细胞丰度增加。MCDD中与WT相比Lyz2CreRbpjfl/fl组Ly6Chi单核细胞和MoKCs相对较少,而Ly6Clo单核细胞和增殖KCs较多(图1C,D)。通过流式细胞验证了这些单核和巨噬细胞亚群(图1E)。

图1 RBPJ调节单核细胞来源的巨噬细胞分化

2.RBPJ调节MASH中巨噬细胞亚群的发育轨迹和空间生态位

通过流式进一步验证了RPBJ缺失后单核和巨噬群体的变化。发现MoKCs、Clec4+巨噬细胞和C1qc+巨噬细胞相对数量没有变化。然而,Clec4e+巨噬细胞、Spp1+巨噬细胞和MoKCs的绝对数据量明显降低,其中C1qc1+巨噬细胞受影响最小(图2A-C)。单细胞轨迹推断发现Ly6Chi单核细胞转化为C1qc+巨噬细胞,Spp1+巨噬细胞和MoKCs细胞。RBPJ缺失后显示Clec4e+巨噬细胞代表中间亚群和Ly6Clo单核细胞分支(图2D)。利用小鼠模型研究Ly6Chi单核细胞募集的动力学发现随着时间变化Ly6Chi分化为MDMs,并且这些细胞逐渐表达MHCⅡ和Tim4,Ly6C表达缺失(图2E,F)。Clec4e+巨噬细胞在较早的时间点在总Tomato+巨噬细胞中占主要比例,而C1qc+和Spp1+巨噬细胞在第1周时占同等比例。MoKCs在他莫昔芬治疗后2周成为优势,在4周时占90%以上(图2G),表明它们的半衰期比其他亚群更长。然而,随着时间的推移,所有亚群的绝对数量迅速下降(图2H)。这表明在MCDD诱导的MASH中,MoKCs不能自我维持超过8周。

进一步分析了GSEA,发现与其他两个MDM亚群相比,Clec4e+巨噬细胞中的凋亡信号通路明显上调,其中包括死亡受体基因Fas35的上调表达(图2I)。流式细胞术证实了这一结果,与WT肝脏中存在的其他单核细胞和巨噬细胞亚群相比,Clec4e+巨噬细胞中Fas(CD95)的表达明显高(图2J,K)。综上,在MASH中,募集的Ly6Chi单核细胞迅速分化为寿命较短的Clec4e+巨噬细胞,并在第一周内凋亡死亡,其中小部分分化为C1qc+巨噬细胞和Spp1+巨噬细胞。然后MoKCs出现,逐渐成为优势种群,并与CV一起定位。

图2 RBPJ调节MASH中Mac亚群的发育轨迹

3.RBPJ信号控制着MASH中巨噬细胞亚群的转录组学和功能景观

脂质代谢紊乱、炎症和纤维化都导致MASH的进展。首先,检测了MASH WT与Lyz2CreRbpjfl/fl肝脏中细胞因子和趋化因子的含量。Lyz2CreRbpjfl/fl MASH组促炎因子CCL2和肿瘤坏死因子α(TNF-a)显著降低(图3A)。对scRNA-seq数据进行GO分析显示,Clec4e+巨噬细胞中富集程度最高的通路与炎症反应、细胞趋化性和凋亡信号通路有关代表促炎巨噬细胞亚群(图3B)。另外Clec4e+巨噬细胞分泌的白细胞介素-1b(IL-1b)和TNF-a更高(图3D)。GO分析显示C1qc+巨噬细胞高表达MHC蛋白复合物和抗原加工递呈通路相关基因,而Spp1+巨噬细胞上调结合整合素、脂肪酸、脂蛋白颗粒相关通路相关基因。此外,单细胞数据显示,与WT小鼠相比,Lyz2CreRbpjfl/fl中所有亚群的Ccl2表达显著降低(图3F),这与Ly6Chi单核细胞募集缺陷和Ccl2细胞因子产生减少(图3A)一致。总之,在缺乏Notch信号蛋白的情况下,Ly6Chi单核细胞募集减少,单核细胞向巨噬细胞转化减弱可能共同促进了MASH中促炎细胞因子的表达降低。

虽然MCDD诱导后非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)活性评分比较相似,但小鼠血清中肝纤维化减少(图3H)。还观察到肝脏脂肪变性、小叶炎症和纤维化无显著缓解(图3I,J)。最后,将小鼠数据与人类肝脏的scRNA-seq数据集(瘦与肥胖)进行了整合在人肝脏中发现了转录组相似的Ly6Chi和Ly6Clo单核细胞、cle4e+、C1qc+、Spp1+巨噬细胞、MoKCs和ResKCs群体(图3K,L)。同样,人CLEC4E+巨噬细胞表达最高的促炎基因(图3M)。结果表明,在大多数MASH小鼠模型和人的肝脏中可以鉴定出相似的单核细胞和巨噬细胞亚群,表现出高度保守的细胞功能和代谢特征。

图3 RBPJ信号控制MASH中巨噬细胞亚群的转录组学和功能景观


结论

本文整合了scRNA-seq、谱系追踪和小鼠模型,揭示了Notch-RBPJ信号控制巨噬细胞的发育,影响炎症和疾病的严重程度,抑制RBPJ可降低MASH的严重程度。为MASH的治疗提供了思路。



参考文献

Guo W, Li Z, Anagnostopoulos G, et al,. Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease. Immunity. 2024 Sep 19:S1074-7613(24)00414-X. doi: 10.1016/j.immuni.2024.08.016.


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供稿:科服事业部

审核:市场部





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