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Rloop追星，上海嘉因R-loop CUT&Tag 2.0强势来袭

嘉因 Rloop R-loop
表观遗传上海嘉因表观遗传上海嘉因
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上海嘉因于年初推出Rloop CUT&Tag服务

R-loop是真核生物内广泛存在的三链核酸结构。近年来，R-loop被证明是基因表达和基因组稳定性的调节因子，引起了越来越多的关注。R-loop的全基因组定位可以帮助科学家们对Rloop的发生和功能进行精确研究。


2024年2月嘉因生物推出Rloop CUT&Tag服务， 该服务基于CUT&Tag体系，利用S9.6抗体，在全基因组水平对R-loop进行定位，具体流程包括：磁珠结合细胞/细胞核、S9.6 抗体识别R-loop、IgG二抗孵育、PA-Tn5孵育、DNA回收与建库。



R-loop CUT&Tag实验流程





上海嘉因Rloop CUT&Tag 2.0来啦！

2024年10月15日，嘉因生物本着精益求精的精神，完成了Rloop CUT&Tag的实验升级，推出Rloop CUT&Tag 2.0。Rloop CUT&Tag 2.0对上海嘉因的标准CUT&Tag protocol做了专门的优化，使得1）IP反应的实际投入细胞数从原来的50万降低到20万，这对于样本量少的珍贵样本更加友好2）其次，实验的IP富集效果更强，拥有更高的实验信噪比。



上海嘉因Rloop CUT&Tag 2.0案例


案例一：HEK293T的两个20万细胞的Rloop CUT&Tag高重复性


样本Peak数



LS_20W

S_20W

Peak   number

56849

43850



样本peak分布情况



IGV可视化






案例二：人角质形成细胞系HaCat 10万细胞 VS 20万细胞


样本Peak数



S-10万细胞

S-20万细胞

Peak   number

14690

15406



样本peak分布情况




IGV可视化




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