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艾沐蒽TCR测序助力探索移植后CMV再激活中的T细胞作用机制

TCR CMV 造血干细胞移植

艾沐蒽生物科技

10/09

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巨细胞病毒（CMV）再激活是同种异体造血干细胞移植（allo-HSCT）后的一个重要问题，影响患者的治疗和预后。2024年9月30日浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室专家团队于Virology Journal（IF：4）杂志发表题为“Insights into cytomegalovirus-associated T cell receptors in recipients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation”的文章，该研究采用艾沐蒽的ImmuHub^®TCR测序分析平台探索与移植后CMV再激活相关的TCR库特征，有助于CMV再激活的诊断和治疗。

研究结果

对移植后1个月时7例CMV再激活受者（CRR）和7例CMV未激活受者（CNR）的TCRβ库进行比较分析。结果如下：

与CRR相比，CNR中独特CDR3基因序列和氨基酸序列的数量均显著更高（图1A-B）。

使用Baroni-Urbani and Buser（BUB）指数评估两组的克隆重叠程度（图2），旨在确定CRR和CNR的T细胞库是否存在相似或不同，这可以深入了解它们免疫反应的共同性或独特性。CNR 组克隆重叠率显著高于CRR组，说明对CMV再激活有抵抗力的个体具有较高的CDR3同源性。

然后作者分析了V、J基因使用情况，旨在确定与CRR或CNR相关的基因片段。TRBV6、TRBV23和TRBV7-8在CRR中的表达水平高于CNR（图3），这表明一些V基因与CMV结果相关，并且可能成为早期识别CMV再激活风险的生物标志物。

图4显示了两组之间V-J基因组合的使用频率差异。与之前的研究相一致，与CRR相比，三种VJ组合（TRBV29-1/BJ1-2、TRBV2/BJ2-2 和 TRBV12-4/BJ1-5）在CNR中高度表达。另外该研究还新发现CNR中的TRBV14/BJ2-2和TRBV5-4/BJ1-4表达水平比CRR组更高。作者进一步研究以上5个VJ组合的基因序列，发现 CNRs的多样性高于CRRs。以上结果表明这些VJ基因组合可能在防止CMV感染和再激活方面发挥重要作用。

研究结论

该研究比较了allo-HSCT后早期具有不同CMV结局的受者之间的TCR序列，发现受者移植后TCR库的早期特征与CMV结果相关，可作为进一步研究的基础。该研究增强了对T细胞在CMV再激活中作用机制的理解。

文献来源：Xia J, Xiao Y, Gui G, Gong S, Wang H, Li X, Yan R, Fan J. Insights into cytomegalovirus-associated T cell receptors in recipients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Virol J. 2024 Sep 30;21(1):236. doi: 10.1186/s12985-024-02511-x.

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关于艾沐蒽

杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年，是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业。创始人团队来自美国芝加哥大学，在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究，于2016年通过自主研发，全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病（MRD）检测Seq-MRD^®，并授权泛生子使用。同时，公司拥有Immun-Traq^®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq^®|T细胞免疫测评以及ImmuHub^®免疫组测序科研服务产品，并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier^®肿瘤早筛、单细胞测序、TCR-T和抗体发现等平台管线。目前为止发表了数十篇论文，其中包括：The New England Journal of Medicine(IF:158.5), Nature(IF:65), Signal Transduction and Targeted Therapy(IF:40), Cellular and Molecular Immunology(IF:24), Nature Communications (IF:17)等多篇高分杂志。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系，为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗，并致力于推进免疫驱动医学领域发展。