项目文章 | 单细胞多组学揭示肿瘤微环境中的遗传密码与免疫治疗新策略

破译肿瘤微环境(TME)的组成对于理解肿瘤发生和设计免疫疗法至关重要。

2024年9月2日，武汉大学缪小平、田剑波共同通讯在Nature Immunology（IF=27.7）在线发表题为“An atlas of genetic effects on cellular composition of the tumor microenvironment”的研究论文，该研究绘制了肿瘤微环境中细胞组成的遗传效应图谱。

利用单细胞和bulk RNA测序数据绘制了基因对细胞类型比例的影响，研究人员从癌症基因组图谱中鉴定了23种癌症类型的3494个免疫定量性状位点(immunQTLs)。功能注释揭示了调控潜力，并进一步确定了1668个调控TME组成的基因。通过整合来自欧洲和中国结直肠癌(CRC)样本的数据构建了一个联合免疫QTLs图谱。在一项全基因组关联研究中，包含这些免疫QTLs和命中点的多基因风险评分在447,495名多种族个体的CRC风险分层中表现优于其他多基因风险评分。通过大规模人群队列发现，免疫QTL rs1360948与CRC风险和预后相关。机制上，rs1360948-G等位基因增加CCL2表达，募集调节性T细胞，可对结直肠癌的进展发挥免疫抑制作用。阻断CCL2-CCR2轴增强抗程序性细胞死亡蛋白1配体治疗。最后，建立了一个数据库(CancerlmmunityQTL2)。