Br J Cancer影响因子8.8|上海嘉因CUT&Tag、ATAC-seq和ChIP-seq客户文章|染色质可及性与PDAC

2023年6月，山东大学第二医院王传新、山东大学齐鲁医院徐硕/展翰翔团队在British Journal of Cancer杂志上发表学术论文“Chromatin accessibility uncovers KRAS-driven FOSL2 promoting pancreatic ductal adenocarcinoma progression through up-regulation of CCL28”，阐明了KRAS驱动的Fos-like antigen 2 （FOSL2）通过转录激活C-C motif chemokine ligand 28 (CCL28)加速胰腺导管腺癌（Pancreatic Ductal Adenocarcinoma，PDAC）进展，揭示了FOSL2在PDAC中的免疫抑制作用。

在胰腺导管腺癌进展中，表观遗传学机制了解的仍较少。本研究通过多组学测序确认在PDAC中发挥关键作用的转录因子，并探索在其在PDAC中的分子机制。研究使用了ATAC-seq、H3K27ac-ChIP-seq和RNA-seq，用以描绘PDAC基因工程小鼠模型的表观遗传学景观，模型包括具有或不具有KRAS和/或TP53突变。使用Kaplan–Meier方法和多变量Cox回归分析评估FOSL2对PDAC患者生存率的影响。使用CUT&Tag知晓FOSL2的潜在靶点。使用CCK8、transwell迁移和侵袭、RT-qPCR、Western印迹分析、IHC、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告和异种移植模型，来探索FOSL2在PDAC进展中的功能和潜在机制。研究结果表明在PDAC进展过程中，表观遗传变化在免疫抑制信号传导中发挥作用。此外，FOSL2是PDAC的关键调节因子，在PDAC中其表达量上调并与患者的不良预后有关。FOSL2促进细胞增殖、迁移和侵袭。研究同时表明，FOSL2作为KRAS/MAPK通路的下游靶标，通过转录激活CCL28来募集调节性T（Treg）细胞。这一发现强调了涉及KRAS/MAPK-FOSL2-CCL28-Treg细胞的免疫抑制调节轴在PDAC发展中的作用。

文中CUT&Tag、ATAC-seq和ChIP-seq实验由上海嘉因生物协助完成。