RNA干扰 V.S 基因编辑
RNA干扰(RNAi)是一种转录后基因调控,即通过小干扰RNA诱导同源RNA降解, RNAi对同源基因的序列特异性沉默可以是由小干扰RNA(siRNA)、短发夹RNA(shRNA)触发, 由于基因靶向的高特异性,使得RNAi成为一种合适的工具来进行基因的功能性评估,不过同样存在“脱靶”情况,如siRNA进入miRNA通路下调非预期靶基因表达或激活天然免疫系统等。 CRISPR-Cas9介导基因组编辑是由sgRNA引导,Cas9蛋白可以实现对目的基因的定向切割,使DNA产生双链断裂(DSB),经过细胞自主性的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HR)进行修复,实现对靶基因进行敲除、插入和突变修饰。 与siRNA和shRNA类似,CRISPR系统靶向基因的特异性由与sgRNA的序列互补性决定。
吉玛基因
Science子刊:碱基编辑疗法治疗罕见免疫缺陷疾病
人们已经发现,X-CGD由细胞色素b-245的β链( CYBB )基因突变引起,这样的特征让科学家们看到了通过碱基编辑器来纠正 CYBB 突变的希望。 不过,碱基编辑器使用的Cas9酶需要存在原间隔区相邻基序(PAM),这样的特点限制了碱基编辑器的应用。 不过,基于SpRY的碱基编辑器纠正造血干细胞和祖细胞(HSPC)突变的效率、特异性与适用于尚未得到广泛研究。
医麦客
Nature子刊:杨辉/张海南/黄锦海团队开发出靶向范围更广的微型碱基编辑器,实现小鼠体内Cas9难编辑位点的高效编辑
CRISPR/Cas9系统 自发现以来,得到快速发展已被广泛应用生命科学基础研究、基因治疗、动植物育种改良等领域。 基于Cas9切口酶 (nCas9) 与脱氨酶结构域/糖基化酶 (MPG或UNG) 的融合成的碱基编辑器 (ABE、CBE、gGBE、gTBE) ,可高效实现A-to-G、C-to-T、C-to-G、G-to-C/T,以及T-to-G/C的碱基替换,为纠正突变的疾病位点提供了精准高效基因编辑工具。 然而由于Cas9的体积过大 (1368个氨基酸) ,基于nCas9的碱基编辑器难以实现单个AAV的包装递送 (极限为4.7kb) ,极大限制了在体基因编辑的发展应用。
派真生物PackGene
广州健康院利用自制工具猪模型发现Cas9蛋白在体内基因编辑中的新安全隐患
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学/王可品课题组在Signal Transduction and Targeted Therapy杂志上发表了题为In vivo evaluation of guide-free Cas9-induced safety risks in a pig model的研究论文。 CRISPR/Cas9系统由Cas9蛋白和单链导向RNA(sgRNA)组成,因其强大的基因组改造能力而备受关注。 目前,对Cas9蛋白本身导致的安全性风险的评估仅限于体外细胞实验研究,而对于在体基因治疗,亟需在体评估Cas9蛋白导致的安全性风险。
中国科学院广州健康院