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Cancer Discovery | 揭示透明细胞性肾细胞癌不同亚型与肿瘤微环境的共同进化模式

SETD2 肾细胞癌 细胞性肾细胞癌
透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 常表现出与疾病进展相关的瘤内异质性 (intratumor heterogeneity, ITH) ,如染色体臂9p和14q的丢失对于对于转移必不可少,但这些遗传特征如何与肿瘤微环境 (TME) 共同进化仍然未知。 近日,来自弗朗西斯·克里克研究所的 Samra Turajlic 团队在 Cancer Discovery 杂志上发表了一篇题为 Tracking Nongenetic Evolution from Primary to Metastatic ccRCC: TRACERx Renal 的文章,他们 通过对来自79名参与TRACERx肾脏研究 (NCT03226886) 患者的243个样本的基因组-转录组学联合分析,揭示了肿瘤和T细胞库之间的共同进化,以及TME从抗肿瘤状态到免疫抑制状态的转变,这与获得复发性晚期ccRCC驱动因子9p丢失和SETD2突变有关,总之,该研究报道了临床相关且迄今未被充分认识的ccRCC与TME的共同进化模式 。 本研究的重点在于探索ccRCC不同亚型与TME之间的相互作用,因此,该团队对来自TRACERx肾脏研究 (NCT03226886) 的79名ccRCC患者的含不同阶段的243份样本进行RNA-seq分析,并重点评估TME组成与不同进化轨迹之间的关系,经比较发现TRACERx揭示的7种亚型 【1】 以不同的TME免疫谱为特征,例如,VHL WT肿瘤表现出内皮细胞和所有免疫细胞的显著耗竭,尤其是NK细胞和CD8+ T细胞,而BAP1驱动型则表现出更高水平的免疫浸润,尤其是髓系细胞,尽管PBRM1-mTOR、PBRM1-SETD2和PBRM1-SCNA肿瘤也显示出免疫浸润的总体增加,但浸润模式各不相同,如PBRM1- SCNA肿瘤的髓系细胞丰度相对较高,而PBRM-mTOR,特别是PBRM1-SETD2肿瘤的CD8+T细胞的相对丰度更高。
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