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为什么同样复杂的化学结构,我画2分钟,别人1秒就画完了?

绘制化学结构 StoneMIND Collector
药融圈
2021/10/26
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注:本文不构成任何投资意见和建议,以官方/公司公告为准;本文仅作医疗健康相关药物介绍,非治疗方案推荐(若涉及)。因水平有限,错误不可避免,或有些信息非最及时,欢迎留言指出。



第一次听说绘制化学结构只需一键截图,一秒提取化学结构!

十分好奇这种黑科技,于是研究发现一键截图实现一秒绘制化学结构是应用OCSR(化学结构识别)技术进行化学结构提取的工具,如Collector、Img2Chem和InDraw等,一木深度使用这几款产品后,强烈推荐Collector给大家使用。



Collector 软件简介



StoneMIND Collector,简称Collector,由国内AI制药企业北京望石智慧科技有限公司开发,于2021年9月正式推出Windows & MacOS版本;Collector基于OCSR(化学结构识别)和IUPAC(标准化学名称识别)技术,能从专利、文献及各类图片中截屏提取或批量上传文件提取化学结构,并将提取的结果导出为计算机可读的格式(sdf/mol/smiles/xls),节省科研工作者绘制化学结构时间并快速搭建自己的化学信息数据库,所有用户均可下载免费使用该产品。


下载地址



https://stonewise.cn/mol_product?channel=5(复制该链接至PC浏览器中打开,点击客户端下载即可获取产品Windows & MacOS版本安装包)



Collector 软件特色



01识别准确度领先市面上同类免费产品

为了测试化学结构的识别速度和识别准确度,一木使用结构相对复杂的天然产物进行测试。

▲ Collector识别结构

根据一木的测试结果,对于结构较为简单的识别,Collector、Img2Chem和InDraw的识别准确率都很不错,而在比较复杂化学结构的识别上,如多元环、螺环、手性的复杂化学分子结构式、天然产物来源复杂结构化合物结构式,Collector的准确率要明显优于Img2Chem和InDraw。当然,识别的准确率与多种因素相关,在实际应用中,可通过放大结构式图像、多次截图尝试来获得更加准确的结果。对于结构准确性的检查至关重要,三款软件都提供了功能齐全的结构编辑器,支持实时校正识别后的结构,Collector和InDraw还具备一键美化结构功能。


在识别的速度上,Collector、Img2Chem和InDraw三款软件并未表现出明显的差异,对于图片清晰、结构较为简单的图像识别,三款软件均能快速的识别,耗时均在1秒左右,对于结构较为复杂的化合物,则可能需要2~3秒的时间。此外,Collector、Img2Chem均可使用快捷键来识别图像,Collector还可双击桌面悬浮窗来快速截图识别,大大提升了使用效率。

02 收藏识别后结构获取分子信息预测结果

基于AI的算法模型及各类知识规则预测一系类分子的性质例如结构性质(类药性/可合成性/分子量/氢键受体及供体数目/PSA/芳香环数目)、理化性质(溶解度/LogP)、DMPK性质(Caco-2肠渗透性/生物利用度/血浆蛋白结合率/血脑屏障穿透率/PGP底物/CYP450抑制剂)、毒性(h-ERG-心脏毒性)。在软件里将识别的分子点击收藏后再点击收藏夹跳转网页版即可查看该分子的所有预测性质。这些信息的反馈,对于药学领域研究人员来说,极为珍贵!对于结构的理解,帮助极大!再赞~


03 识别后结构格式兼容Chemdraw及其他画图和CADD软件

很多人习惯了ChemDraw里画结构和进行各种基团部位的修饰,Collector也能一键复制smiles或者mol直接在ChemDraw里打开。支持下载为sdf文件格式,可在ChemDraw/InDraw/KingDraw专业画图软件及各类CADD软件中打开查看和进一步编辑。



Collector软件主要功能总结



  • ● 结构美化
  • 支持一键美化结构。
  • ● 名称转结构
  • 支持IUPAC名称转结构。
  • ● 编辑校正
  • 包含功能齐全的结构编辑器,支持识别后对化学结构的二次修改。
  • ● 快捷截图
  • 一键截图,随时随地截取化学结构;左右对照视图,方便识别后的化学结构对比操作。支持自定义快捷键截图识别化学结构。
  • ● 收藏预测
  • 支持将识别后的化学结构收藏起来,方便下次使用查看。识别后的结构点击收藏支持查看各类分子性质预测结果。
  • ● 格式多样
  • 支持复制成MOL和SMILES两种文件格式。支持下载为sdf文件格式,可支持在ChemDraw/Indraw/Kingdraw专业画图软件及各类CADD软件中打开查看。
  • ● 缩写+模板丰富
  • 支持1000种常见基团简写插入和直接识别成mol/sdf/smiles格式。丰富的绘图模板库,糖类,环类、碱基类、L型氨基酸等14种模板
  • ● 网页版本支持批量提取
  • 可上传任意pdf或者图片,后台自动提取(化学结构识别)和IUPAC(标准化学名称识别)提取结构,该网页版目前为免费Beta版本。

科研是枯燥的,科研也可以是快乐的。攻克难题是快乐的,完成很漂亮的论文图表就像亲手创造艺术品一样,也是成就感满满。希望这款软件可以成为你的科研利器,助你乘风破浪,疾驰远航!


温馨提示



1. 在Collector客户端点击左侧导航栏图标,即可观看产品使用视频。

2.打开望石智慧官网www.stonewise.cn,点击产品介绍下的StoneMIND Collector, 有该产品的详细介绍和使用视频。

3.任何产品使用问题或建议可直接联系Collector微信客服,请扫下方二维码添加微信或工作日9:00-18:00拨打手机号15711471378(微信同号)。

4. 安装方式有部分用户可能会遇到软件包的下载安装操作被自动拦截,这受限于您的电脑安全设置策略,请手动允许其下载和安装,该软件安全无毒,请放心使用。




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