NSMB | DNA超螺旋结构域与染色质Compartments共定位且调控基因表达
DNA超螺旋 (DNA supercoiling) 是在DNA双螺旋结构的基础上进一步螺旋化形成的螺旋结构,根据手性方向不同分为正超螺旋和负超螺旋。 作为基于双螺旋结构的一种DNA的基本物理学性质,尽管DNA超螺旋在生物过程中有重要功能,但我们对于其在染色质和基因组中的动态调节过程、机理和功能的理解仍然十分有限。 相比我们对其他很多染色质性质和结构的深入大量研究,这其中缺失的重要环节是一种准确、定量检测活细胞中基因组DNA超螺旋的可靠方法。
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Nature Methods | 革新癌症治疗:EpiChem技术揭示药物与染色质结合的单细胞层面机制
在癌症治疗中,小分子抑制剂通过靶向基因组和表观基因组相关蛋白质来发挥作用,因此研究这些小分子抑制剂在分子和细胞层面的功能尤为重要。 7月18日 Nature Methods 的研究报道“ Single-cell EpiChem jointly measures drug–chromatin binding and multimodal epigenome ”介绍了一种新方法 EpiChem,这是一种原位单细胞联合绘图技术,能够同时测量小分子药物与染色质的结合以及多模态的表观基因组特征 。 EpiChem通过在单细胞水平上联合检测多种小分子药物与组蛋白修饰、染色质可及性或靶蛋白的共测实验,展示了其在研究人类结直肠癌(CRC)类器官中的多样化药物相互作用的能力 。
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