Nature | 探索早期胚胎DNA复制:揭秘基因组不稳定性与复制时间程序
单细胞DNA复制状态分析 (scRepli-seq) 技术作为一种单细胞DNA复制测序技术,能够以单细胞分辨率对DNA复制状态进行全基因组分析 【3】 。 该技术能够揭示DNA复制在不同细胞类型中的时间和空间模式,并检测染色体异常。 因此,scRepli-seq技术为研究早期胚胎DNA复制提供了强有力的工具。
BioArt
广州健康院发现调控基因组稳定性的新的细胞质因子
基因组经常受到内源和外源因子的影响而发生损伤,持续DNA损伤会引起基因组不稳定性增加,激活DNA损伤反应(DDR),最终会抑制细胞周期进程。 维持基因组稳定性对于防止癌症发生及过早衰老十分重要,探究维持基因组稳定性的新机制对于理解衰老及衰老相关疾病具有重要意义。 这些结果说明YIPF2通过对这两个过程的调控促进DNA损伤修复,从而参与基因组稳定性维持。
中国科学院广州健康院
昆明植物所成功解析九倍体木本竹的基因组
竹子即竹亚科(Bambusoideae )是禾本科的一个重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。 作为一类生长快、多年生的、可再生森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要经济价值和生态价值。 竹子包含二倍体的草本竹子(2n=2x=20-24)、四倍体木本竹子(2n=4x=46 - 48)和六倍体木本竹子(2n=6x=70-72)。
中国科学院昆明植物研究所
bioRxiv|GeneBac:基于序列的细菌基因组建模方法用于准确预测抗生素耐药性
抗微生物药物耐药性 (Antimicrobial Resistance, AMR) 是一个重要的全球性问题,每年超过127万人的死亡与之相关。 在抗击AMR的挑战中,一个关键难题是如何迅速且准确地识别出药物的敏感性或耐药性,从而确保合理用药。 为了解决这些问题,剑桥大学R. Andres Floto教授团队通过深度学习模型GeneBac对DNA序列分析来预测细菌对抗生素的最小抑制浓度 (Minimum inhibitory concentration, MIC) 。
智药邦
RNome计划:人类基因组计划进阶版
据估计,RNome计划大约需要总金额300亿美元支持,是人类基因组计划的10倍。 该计划将是继人类基因组计划之后的又一项大规模的研究计划,其对生命科学研究、工业及产业发展的影响将不亚于人类基因组计划。 生命过程依赖于三大关键分子,即脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)和蛋白质。
创药网
eLife丨葛照嘉/孙青原团队揭示肥胖影响卵子基因组甲基化重建及跨代遗传效应的机制
肥胖是常见的具有代际和跨代传递倾向的代谢性疾病。 我们团队前期研究发现,肥胖小鼠卵母细胞中编码瘦素的基因和 Pparɑ 基因启动子区甲基化异常 (Ge ZJ et al, Environ Health Perspect,2014) 。 王强教授团队发现肥胖小鼠卵母细胞中 Stella 基因表达降低,造成受精卵中雌原核快速去甲基化和胚胎发育异常 (Han L et al, Nat Genet, 2018) 。
BioArtMED
R-loop CUT&Tag系列文章之六:R-loop与基因组稳定性
接着前五篇有关R-loop CUT&Tag的系列文章,包括 R-loop概览 、 R-loop与表观遗传 、 R-loop与转录终止 、 R-loop CUT&Tag 系列文章之四-R-loop CUT&Tag技术原理和技术对比 和 R-loop CUT&Tag系列文章之五:上海嘉因实操R-loop CUT&Tag数据大解密 ,本篇文章将介绍R-loop与基因组稳定性的关联性。 R-loop与DNA双链断裂修复。 当活跃转录区域形成DNA单链断裂或双链断裂 (double-stranded break, DSB) 时,会触发多种修复途径,使断裂附近的转录下调。
上海嘉因生物