中南大学王建新教授团队提出BANDRP模型,通过基于分子指纹和多组学的双线性注意力网络进行药物反应预测
预测药物反应(一般而言是预测药物在细胞系上的IC50的值)有助于药物发现与疾病的个性化治疗。 目前,虽然已有一些人工智能方法用于药物反应预测,但这些方法仍然受到输入特征信息冗余和特征之间复杂相互作用的限制,因而难以有效整合与细胞系、药物及其已知反应相关的各种特征,以实现药物反应的精准预测。 与现有模型相比,BANDRP利用基因表达数据计算通路富集分数来丰富细胞系特征,并通过双线性注意力网络自动学习细胞系与药物的交互信息。
智药邦
Cell Metab | 多组学揭示2型糖尿病的遗传因素和环境压力作用
2型糖尿病 ( T2D ) 是一种常见的慢性代谢性疾病,其特点是身体不能有效利用胰岛素 (胰岛素抵抗) 或胰腺无法分泌足够的胰岛素,导致血糖水平升高 【1-3】 。 胰岛素是一种由胰腺β细胞分泌的激素,帮助细胞摄取和利用血糖。 T2D的主要风险因素包括不健康的饮食、缺乏运动、超重或肥胖、遗传因素和年龄的增长。
BioArt
Adv Sci丨基于多组学与机器学习的枯草芽孢杆菌全基因组代谢模型优化基因表达与细胞生长预测
近日, Advanced Science 在线发表了江南大学未来食品科学中心和生物工程学院 陈坚 院士团队 刘龙 教授课题组的研究成果 A multi-omics, machine learning-aware, genome-wide metabolic model ofBacillus subtilisrefines the gene expression and cell growth prediction 。 然而,许多机器学习模型忽视了生物背景,限制了模型的可信度和解释性。 针对上述问题,该研究标准化建立了枯草芽孢杆菌高质量综合数据库,并搭建了枯草芽孢杆菌多组学综合代谢网络模型,设计了34个机器学习模型,将机器学习模型与多组学综合代谢网络模型相结合,实现了基因表达与细胞生长的精准预测。
BioArtMED
战略合作 | 序祯达生物与华大智造共建DCS Lab,开启多组学研究新篇章
2024年9月9日, 上海序祯达生物科技有限公司(以下简称“序祯达生物”)与华大智造达成战略合作,并正式宣布“序祯达生物-华大智造DCS Lab认证实验室(以下简称‘DCS Lab’)”在序祯达生物落成。 依托于华大智造平台工具,DCS Lab的启用将为序祯达在生物医药、精准医学、合成生物学等前沿科学领域提供组学研究支持,进一步推动双方在相关领域的创新发展。 作为多组学服务的行业引领者,序祯达生物拥有符合国际标准的先进多组学平台,涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学以及单细胞、时空组层面的多组学检测与分析。
华大智造MGI
MS-ZTV平台发布!单细胞多组学和斑马鱼基因编辑技术,赋能多维度基因功能验证研究!
为更好地推动单细胞 多组学与斑马鱼技术的广泛应用与纵深发展 ,助力科学研究, 近日, 新格 元与环特生物 深化战略合作, 共同发布了“MS-ZTV平台解决方案 ” 。 MS-ZTV(Multi-omics Sequencing -Zebrafish Target Validation)平台,即 融合组学和斑马鱼基因编辑技术进行多维度基因功能验证研究, 将聚焦单细胞多组学与斑马鱼基因编辑技术方案的联合应用,致力于提升学校及临床科研 工作者科技能力与水平 ,也为揭示疾病机制、攻克遗传性疾病等提供强有力的技术支持。 打造的“ GS-ZTV ”平台。
新格元