今年6月,《新英格兰医学杂志》(NEJM)发表一篇有关新冠病毒疾病(COVID-19)的全基因组关联研究,初步鉴定出两个基因位点(3p21.31位点rs11385942和9q34.2位点rs657152)与重症显著相关。近日,NEJM以通讯文章新发表的两项研究进一步阐明了这两个基因相关的蛋白质在新冠感染中可能起到的作用。
截图来源:New England Journal of Medicine
来自英国惠康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)的团队观察到,rs657152-A变异与深静脉血栓和肺栓塞的风险有关,而这两种情况在COIVD-19重症患者中普遍存在。相关变异还与较高水平的凝血蛋白以及白介素6(IL-6)相关,在COIVD-19重症患者中这些指标也常常升高。rs657152-A也与较高水平的CD209有关,此前的研究已经发现CD209可以促进SARS病毒和其他病毒的感染。
第二项研究来自哈佛医学院贝丝以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)研究团队。基于一个庞大的数据库——来自三个队列研究共4856名黑人和白人受试者的1305种循环蛋白的测量结果,研究人员进行了分析。
他们同样发现,rs657152-A变异与CD209有关。在上述三项队列研究的数据中,研究人员分别发现了rs657152-A与多种炎症蛋白、粘附蛋白水平有关,而且这些遗传变异和蛋白质的关联可能因种族而异。
此外,他们还观察到3p21.31位点的变异与CXCL16水平有关,CXCL16是一种与肺泡炎和动脉粥样硬化有关的炎症趋化因子。
这些发现提示,全基因组关联研究中鉴定出的基因位点影响病情严重程度的潜在机制包括:参与病毒结合受体的过程,以及影响血栓、炎症和动脉粥样硬化。
参考资料
[1] Mohd Karim, et al., (2020). Mining a GWAS of Severe Covid-19. N Engl J Med, DOI: 10.1056/NEJMc2025747
[2] BIDMC researchers reveal how genetic variations are linked to COVID-19 disease severity. Retrieved November 26, 2020, from https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-11/bidm-brr112520.php
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