线粒体DNA与核基因组DNA由线粒体膜和核膜分别包裹，互相隔绝。 然而在“内共生学说”中，原核生物来源的线粒体基因组DNA随着生物演化逐渐转移到了核基因组DNA中。 这些核基因组上的线粒体DNA片段（nuclear-mitochondrial DNA segments，NUMTs），近年来在人类基因组中也被广泛发现。
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