RNA Pulldown实验,是一项用于筛选与靶RNA结合的蛋白质的定性实验。通过体外转录法或合成生物素标记RNA探针,与细胞裂解液孵育,形成生物素-RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素磁珠结合,从而将靶RNA结合的蛋白从细胞裂解液中分离出来。洗脱后的复合物,可以通过Western Blot实验,检测靶RNA是否与已知的蛋白结合,还可以通过银染-质谱法,高通量筛选与靶RNA结合的众多未知蛋白。
RNA Pulldown实验操作步骤较为复杂,需要丰富的技术经验,在实验的过程中,需要根据不同情况优化实验方案,摸索最适的实验条件,才能得到可靠的实验结果。对于刚开始接触RNA Pulldown实验的老师,可能会对实验产生疑惑,为了便于大家理解实验原理和操作步骤,我们整理了RNA Pulldown实验的大致流程,如图1所示:
图1 RNA Pulldown实验流程图
另外,如果通过RNA Pulldown实验筛选得到了与靶RNA结合的蛋白,需要反向验证该蛋白是否可以将靶RNA拉下来,可以通过RNA免疫沉淀(RIP)实验进行验证,正反向同时验证,可以充分说明RNA与蛋白的结合关系。
吉玛基因提供经验丰富的RNA Pulldown实验和RIP实验服务项目,为初入实验室的您,解决实验操作难的困扰。如果您的课题研究涉及该两项实验,欢迎垂询!
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