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  • Cell Genom.丨基于微扰转录组知识图谱嵌入的化合物-蛋白质相互作用预测

    Cell Genom.丨基于微扰转录组知识图谱嵌入的化合物-蛋白质相互作用预测
    近日，中国科学院上海药物研究所 郑明月 课题组，在 Cell Genomics 期刊发表题为 Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation transcriptomics 的研究论文。 化合物和蛋白质是药物发现中两个最基本的实体，建模它们之间的相互作用是药物发现的基础。 尽管目前仍然没有一种通用的计算方法可以预测和解释所有的化合物-蛋白质相互作用，但是研究人员们可以利用不同的生物数据、从多种研究视角构建化合物-蛋白质相互作图谱。
    BioArtMED
    中国科学院上海药物研究所 蛋白质相互作用
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    1个月前
  • “赛”出新质生产力｜“计算生物学“两万里挑一”的“活性分子”诞生

    “赛”出新质生产力｜“计算生物学“两万里挑一”的“活性分子”诞生
    为进一步落实《上海市计算生物学创新发展行动计划（2023一2025年）》，推动上海计算生物学发展，在上海市科委指导下，上海市生物医药科技产业促进中心与中国科学院上海药物研究所、华为云等共同举办了2023上海国际计算生物学创新大赛（以下简称“大赛”），致力于推进计算生物学的进步并激发生物医药科技的创新潜力。 本次2023上海国际计算生物学创新大赛聚焦人工智能在离子通道药物开发中的应用，采用干湿实验相结合的创新赛制，旨在实际验证算法并推动其迭代优化。 自赛事公布之日起，首届即吸引了逾1300名专业人才报名，组建了超过330支团队参与竞争。
    上海科技
    中国科学院上海药物研究所 计算生物学
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    2个月前