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  • Nature Methods | 能否通过数学模型揭示细胞周期的真实速度？VeloCycle有答案

    Nature Methods | 能否通过数学模型揭示细胞周期的真实速度？VeloCycle有答案
    传统的RNA速度推断方法，诸如velocyto和scvelo，通常存在着统计不一致性的问题，不同基因的速度估计往往缺乏统一的尺度和几何控制。 （10月31日 Nature Methods “ Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations ”）。 VeloCycle的原理与创新。
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    细胞周期
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    1周前
  • Mol Cell | P小体中的mRNA随细胞周期变化

    Mol Cell | P小体中的mRNA随细胞周期变化
    P body小体 （ PB ） 是广泛存在于真核生物细胞中的核糖核蛋白 （RNP） 颗粒 ，其中含有各种参与翻译调控和RNA降解的RNA结合蛋白 （RBP） 和RNA分子，但是在细胞周期中PB的内含物如何变化以适应细胞需求仍不清楚。 近日，来自法国索邦大学的 Dominique Weil 和 Adham Safieddine （第一作者兼共同通讯） 研究团队在 Molecular Cell 上发表题为 Cell-cycle-dependent mRNA localization in P-bodies 的文章， 发现PB中的RNA分子随着细胞周期是高度动态化的，但并不随着细胞质中的RNA一起变化，mRNA的PB定位是由RBP和RNA特征调控的 。 研究人员首先观察了在细胞周期中PB的形态变化，发现从G1到G2期PB体积变大，接下来他们从不同细胞周期的细胞中分离纯化了PB并进行了蛋白质组分析检测其内含物，发现主要的PB蛋白随着细胞周期并不发生变化。
    生物探索
    RBP 细胞周期 细胞
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    3周前