颜宁团队再次突破!发现《荷塘月色》未知物体,报道结构生物学研究新范式
结构生物学正在经历从目标结构确定到结构导向发现以前未表征的生物实体的范式转变。 2024年10月9日, 清华大学颜宁及李张强 共同通讯在PNAS在线发表题为“ CryoSeek: A strategy for bioentity discovery using cryoelectron microscopy ”的研究论文。 该研究采用冷冻电子显微镜(cryo-EM)对清华荷塘的过滤水样进行了分析,报告了两个高度相似的螺旋原纤维的结构测定和表征,命名为 TLP-1a 和 TLP-1b ,每个直径约8 nm,宽15-Å。
Being科学
bioRxiv|利用生成式AI进行初级结构生物学建模
2024年5月13日,来自罗格斯大学、罗格斯癌症研究所、罗格斯新泽西医学院的研究人员在bioRxiv上发表文章Generative artificial intelligence performs rudimentary structural biology modeling。 本文探索了GPT-4在初级结构生物学建模中的应用,包括为20个标准氨基酸和α螺旋多肽链建立三维结构模型,以及分析药物与其靶标蛋白之间的相互作用。 此外, GPT-4还能识别参与配体结合的特定氨基酸残基及相应键距,展示了其在原子尺度精度下进行基本结构生物学建模和相互作用分析的能力 。
智药邦
功能合成生物学
这种重新定位将使生物装置的工程与这些装置的使用方式的具体细节脱钩,这将需要概念和组织上的变革,以及支持软件工具的开发。 实现功能合成生物学的愿景将允许更灵活地使用装置,为装置和数据的重用提供更多机会,提高可预测性,并降低技术风险和成本。 在过去的十年中,合成生物学家在生物系统的工程化方面取得了巨大进步。
药时空