近日，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所 李斌 课题组及合作团队在国际期刊 Journal of Clinical Investigation 在线发表了题为 Non-classical action of Ku70 promotes Treg suppressive function through a FOXP3-dependent mechanism in lung adenocarcinoma 的研究论文。 研究同时表明Ku70对人Treg细胞的抑制功能的维持也发挥了关键作用。 进一步机制分析显示Ku70通过与Treg核心转录因子FOXP3直接结合影响FOXP3靶基因的转录调控。

近日，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所 吴学锋 课题组联合 李斌 课题组在 The Journal of Clinical Investigation 杂志在线 （In-Press Preview） 发表了题为 TMED4 facilitates Treg suppressive function via ROS homeostasis in tumor and autoimmune mouse models 的研究论文。 通过IRE1α-XBP1信号通路和NRF2相关的抗氧化反应，TMED4促进Treg细胞ROS稳态，从而维持细胞Foxp3的表达及抑制功能。 缺失TMED4的Treg细胞在小鼠肿瘤模型和自身免疫疾病模型中均促进了效应性T细胞的活化，进而提高抗肿瘤免疫力或加重自身免疫疾病症状。

作为重要的调节因子，生长素分布在整个植物体内，但在空间上以不同的方式协调植物的生长。 植物通过生长素响应因子（Auxin Response Factor, ARF）调节生长素驱动的转录反应。 近日，上海交通大学农业与生物学院刘路课题组在 Developmental Cell 杂志在线发表了题为 MCTP controls nucleocytoplasmic partitioning of AUXIN RESPONSE FACTORs during lateral root development 的研究论文。

2024年9月6日，中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组、中科中山药物创新研究院徐骏宇课题组，联合中国科学院营养与健康研究所秦骏课题组、上海交通大学附属仁济医院薛蔚/董柏君团队、上海交通大学生命科学技术学院李婧课题组于 Nature 子刊 Nature Cancer 发表题为 “Integrative proteogenomic profiling of high-risk prostate cancer samples from Chinese patients indicates metabolic vulnerabilities and diagnostic biomarkers” 的研究论文， 综合基因组、转录组、蛋白质组和磷酸蛋白质组数据，揭示了基因组和转录组分析未完全阐明的前列腺癌分子机制和疾病亚型，加深了人们对前列腺癌临床特征的生物学理解。 前列腺癌（PCa）呈现出东西方人群基因组层面的差异性，这反映在癌症基因组和疾病进展的不同变化中。 在本项工作中，研究人员针对125例癌和癌旁配对的临床原位高危前列腺癌样本进行了蛋白基因组学的全景解析，以增强对于高危前列腺癌预后，诊断和治疗的理解。

一场关于免疫细胞的“变形记”正在掀开医学界对于代谢性肝病的理解和治疗新篇章。 2024年9月23日，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所 Florent Ginhoux 教授团队在 Immunity 上发表了文章 Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease ， 揭示了Notch-RBPJ信号在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中对巨噬细胞命运的神秘调控。 研究首次描绘了炎症“操盘手”——巨噬细胞在肝脏微环境中如何在健康守卫者与疾病推动者之间“换位”，这为开发创新性治疗策略提供了全新启示。

近日，上海交通大学自然科学研究院/物理与天文学院/张江高等研究院/药学院 洪亮团 队 ，设计了一种 扩散概率模型框架（CPDiffusion） ，成功设计并生成了具有增强活性的人工程序化内切核酸酶序列。 这项突破性研究展示了深度学习在蛋白质工程领域的强大潜力，为蛋白质工程、生物技术、分子诊断等领域带来了新的应用前景。 和现有的序列设计方法相比，该方法以极低的模型训练和数据成本学习蛋白质序列、结构和功能之间的隐含映射规则，生成多样化的蛋白质序列，并以极高的成功率通过湿实验验证，最终在两款超长的多结构域复杂功能蛋白（Kurthia massiliensis Ago和Pyrococcus furiosus Ago，简称为KmAgo和PfAgo）得到超过10倍的DNA剪切活性提升， 显著高于现有任何已发现的常温野生型蛋白活性。

2024第十三届中国罕见病高峰论坛于9月6-8日在上海举办。 本届大会由蔻德罕见病中心、上海交通大学医学院附属新华医院联合主办，以“罕路并肩 筑梦前行”为主题。 在9月7日举行的“罕见病与宫内儿科学专场”会议上，众多专家就线粒体疾病、地中海贫血、脊髓性肌萎缩症、苯丙酮尿症等多种罕见疾病的诊断与治疗经验，以及相关领域的最新进展进行了深入的探讨。

胰岛素受体酪氨酸激酶底物 （IRTKS） 是上海交通大学系统生物医学研究院韩泽广科研团队首先分离和命名的基因，现其不仅能够调节细胞膜伪足的形成，而且在肿瘤发生发展、胰岛素信号转导以及抗病毒免疫反应等过程中都发挥着重要的作用 （Cell Research, 2013；Gut, 2018；Nature Communications，2015；Cancer letters, 2013；Int. J. Mol. Sci. 2019） 。 最近，他们还发现IRTKS能调控组蛋白修饰 （Cancer letters, 2023） ，但具体的表观遗传调控机制尚不清楚，尤其是对异染色质的调控方式及其作用机制还未知。 而异染色质作为真核生物细胞核的重要组成部分，在基因组稳定性的维持、基因表达、胚胎发育和衰老等过程都中发挥关键作用。

近期， 上海交通大学生命科学技术学院/医学院临床研究中心俞章盛教授课题组与合作者 在 《Nature Communications》 在线发表了题为 “HEARTSVG: a fast and accurate method for identifying spatially variable genes in large-scale spatial transcriptomics” 论文。 该研究提出了 一种用于快速、精确检测大规模空间转录组数据中空间可变基因（SVG）的方法——HEARTSVG，并揭示了其在肿瘤研究等领域的重要应用。 空间转录组学能够测量组织中的基因表达和位置信息，其技术的发展为组织结构重建及多个领域提供了深刻见解。

研发靶向弥漫型胃癌的药物具有重要意义。 肿瘤 细胞 分泌大量的炎症趋化因子 MCP-1/CCL2 ，诱导单核巨噬细胞聚集并发生 M2 极化，导致原本来杀伤肿瘤的机体天然免疫巨噬细胞 杀伤力减弱 。 Diffuse-type gastric cancer (DGC) isasubtype ofgastric cancerwithaggressiveness andpoor prognosis. It is of great significance to find sensitive drugsforDGC.Inthecurrent study,a total of 20 patient-derived organoids(PDOs) were analyzed for screening the therapeutic efficacy of small molecule kinasesinhibitors ongastric cancers, especially the therapeutic difference betweenintestinal-typegastric cancer(IGCs) an