蛋白质作为最重要的生命构建单元之一，其序列和功能之间的映射（适应性景观，Fitness landscape）的针对性研究对于蛋白质理性设计以及工程应用都有极大的意义。 一些更高效的定向进化工具如PACE，OrthoRep等会使得蛋白质空间的搜索深度加深，但由于其专注于产生高适应性突变体的特征使得其对于蛋白功能的全局认知不足。 一些计算方法成功构建起序列-结构之间的精确关联，例如2024年诺贝尔化学奖获奖者开发的AlphaFold, RoseTTAFold等结构预测或设计算法，并进一步试图利用深度学习构建序列和功能的映射关系，但由于缺乏高质量大规模的序列-功能映射数据，计算方法的可延展性始终有所限制。

近日，清华大学 程功 教授团队与合作者在 eBioMedicine 杂志发表了题为 A substitution at the cytoplasmic tail of the spike protein enhances SARS-CoV-2 infectivity and immunogenicity 的研究论文。 此外，这一变异显著提升了新冠病毒样颗粒 （VLP） mRNA疫苗的免疫原性和保护效果。 随后，研究团队将利用新冠病毒反式互补系统探究P1263L突变在真实病毒感染中的影响。

近日，清华大学药学院 唐海东 课题组在 Cell Reports 杂志上发表了题为 PD-L1 protects tumor-associated dendritic cells from ferroptosis during immunogenic chemotherapy 的研究论文。 癌症治疗中的化疗和免疫疗法一直是两种主要手段。 化疗通过杀死快速分裂的癌细胞来抑制肿瘤，而免疫疗法则通过激活机体的免疫系统，增强其识别并攻击癌细胞的能力。

2024年10月29日，清华大学生命学院、CLS生命中心、免疫学研究所、膜生物学全国重点实验室、教育部蛋白质科学重点实验室的刘万里与合作者在国际免疫学顶级期刊《Immunity》发表研究论文《Progressive polyadenylation and m6A modification of Ighg1 mRNA maintain IgG1 antibody homeostasis in antibody-secreting cells》，揭示IgG抗体稳态调控的新机制，并探索其在自身免疫疾病的发病和治疗中的潜在价值。 两千五百年前，古希腊的修昔底德（Thucydides）曾经这样描述公元前430年雅典城的一场瘟疫：“染病而垂死的病人，只能被那些已经染病但侥幸康复的人照顾。 两千五百年后，现代免疫学研究才逐渐的解析了其中的基本生物医学原理：病原体感染机体后，初始型B细胞（Mature naïve B cell）产生抗体抵御病原体；康复者获得记忆性B细胞，此类B细胞承载IgG抗体记忆，遇到相同病原体时快速免疫活化并产生IgG型的病原体特异性抗体，从而有效抵御病原体的致命攻击。

但是，对于这一极为关键的分子与细胞过程，在S期内调控CENPA维持以及确保其在DNA复制过程中表观遗传信息忠实传递的机制仍不清楚。 RNA m 6 A修饰（N 6-甲基腺嘌呤）已被广泛报道几乎参与mRNA生命周期的所有阶段，与一系列复杂疾病的发生发展相关。 近日，北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心、北京大学核糖核酸北京研究中心刘君课题组与清华大学生命科学学院杨雪瑞课题组合作，在 Cell 发表了题为“ m 6 A-modified cenRNA stabilizes CENPA to ensure centromere integrity in cancer cells ”的研究论文。

7月31日，清华大学梁万年、李冠乔等合作在 Nature Reviews Drug Discovery （IF=120.1）发表文章，对近年中国创新药研发趋势进行了分析。 本文数据主要基于医药魔方NextPharma ® 数据库，也是医药魔方提供核心数据支持在顶级期刊上发表的第9篇文章。 清华大学Nature发文：全球传染病疫苗研发蓝图。

近日，清华大学药学院 蒯锐 课题组在 Nature Communications 发表题为 Tuning the fluidity and protein corona of ultrasound-responsive liposomal nanovaccines to program T cell immunity in mice 的文章。 大量研究表明增加实体瘤内肿瘤抗原特异性T细胞数量可提高肿瘤治疗效果。 虽然许多肿瘤疫苗通过靶向淋巴结能有效扩增肿瘤抗原特异性T细胞，但这些T细胞并不总是能够有效到达肿瘤，从而限制治疗效果。

甲病毒（alphavirus） 是一类具有囊膜的单链正义RNA病毒。 它通过蚊子等节肢动物在人类、鼠、马及鸟等多个物种中广泛传播并引起相关疾病。 极低密度脂蛋白受体（very low-density lipoprotein receptor，VLDLR） 是一种新型的甲病毒受体。

2024年8月14日，西湖大学 卢培龙 研究员实验室与清华大学 刘磊 教授实验室合作在 Cell Research 杂志发表了题为 Accurate de novo design of heterochiral protein-protein interactions 的研究论文。 镜像蛋白质多肽药物由D-氨基酸构成，作为一类非传统新型蛋白质多肽药物，在生物医学领域展现出巨大潜力。 其主要优势包括：一、免疫原性低，因免疫系统无法识别D-氨基酸；二、口服给药和长效治疗潜力大，因体内蛋白酶无法降解D-肽键。

B细胞是适应性免疫应答系统的重要组成部分，具有包括分泌病原体特异性抗体等多种免疫效应功能。 生发中心（GCs）中的体细胞超突变和B细胞选择可提高抗体对免疫抗原的亲和力和特异性。 因此，生发中心（GC）B 细胞对产生 GCs 和长效体液免疫至关重要。