广州健康院王杰课题组开发跨物种单细胞组学数据分析的新工具CACIMAR
近日, 中国科学院广州生物医药与健康研究院王杰课题组 开发了新的计算工具 CACIMAR (Cross-species Analysis of Cell Identities, Markers, Regulations), 用于分析跨物种单细胞转录组测序数据(scRNA-seq),揭示物种间细胞类型、标志基因、细胞内调控以及细胞间相互作用的进化保守性。 物种不仅在基因层面,也在细胞类型、基因表达、基因调控、细胞间相互作用等方面显示出进化保守性。 单细胞转录组测序技术已广泛用于不同物种的单细胞表达研究,为在细胞类型水平研究物种的进化保守性提供了新机会。
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