Science|利用放松序列空间优化进行可扩展蛋白设计
蛋白质设计是生物科学和生物技术中的一个重要领域,近年来由于机器学习的进步,尤其是深度学习的引入,这一领域的研究取得了令人瞩目的成就。 本文是一项最新的研究成果,介绍了一种 基于放松序列优化(Relaxed Sequence Optimization, RSO)的蛋白质设计方法,可以高效地生成高质量的蛋白质骨架 。 近年来,蛋白质设计的领域已经因机器学习方法而发生了巨大的变革。
智药邦
重组蛋白的制造趋势
治疗性蛋白的生产利用未经修改或基因修饰的生物实体,包括细菌、哺乳动物细胞、病毒和酵母,来生产大型蛋白质分子。 有些生产系统非常简单,例如生产天然产物如青霉素,因此不包括在本章中。 生产过程始于通过培养建立基因修饰的细胞系,以在生物反应器中表达所需的治疗性蛋白。
生物制品圈
ICE靶标蛋白| RAS系列蛋白产品
RAS蛋白是一种由RAS基因编码的低分子量 GDP/GTP 结合蛋白 ,在细胞生长和分化的信号转导中起关键作用。 在正常的信号转导过程中,RAS以GTP结合形式执行其功能。 它必须通过酶进行修饰,增强其疏水性,与细胞内膜结合。
爱思益普
刷新生物蛋白尺寸极限!Science|揭示迄今为止发现的最大蛋白的合成机制
在一项突破性的研究中, 加州大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋学研究所的研究团队 揭示了一种名为小定鞭金藻(Prymnesium parvum)的微藻如何生产复杂毒素的秘密。 在这个过程中,他们发现了 一个生物学领域中前所未见的巨大蛋白质,被命名为 PKZILLA-1, 这一发现不仅刷新了蛋白质尺寸的记录,还打开了新药研发和新材料探索的大门。 PKZILLA-1与其较小的同僚PKZILLA-2共同构成了小定鞭金藻产生致命毒素——prymnesin的关键。
生物谷
PNAS丨汪方炜/颜海燕/张龙合作揭示黏连蛋白功能的重要调控机制
黏连蛋白 (Cohesin) 是一个在进化上高度保守的环状结构复合体,参与调控一系列基于DNA和染色质的重要生物学过程 (图1) 。 黏连蛋白可以拓扑联结两个DNA分子,通过介导姐妹染色单体粘连 (sister chromatid cohesion) 调控染色体分离、DNA复制和同源重组DNA修复,进而维护基因组稳定性。 黏连蛋白还可以拓扑结合单个DNA分子,通过形成染色质环 (chromatin loop) 调控基因组三维构象和基因转录 【1】 。
BioArt
AI从头设计蛋白,用作生物传感器
因此,长期以来,科学家们一直试图创造全新的蛋白质,并且这些人造蛋白能够像天然蛋白一般通过结合小分子化合物来控制其活性,调控生理活动,从而应用于生产活动和疾病治疗。 这些发现将为蛋白质从头设计和生物传感开辟新的研究方向。 目前,蛋白质设计的一个主要挑战是创造高选择性和高亲和力的小分子结合蛋白。
药渡
David Baker:从头设计蛋白的“上帝之手 ”
美国生化学家、华盛顿大学蛋白质设计研究所所长David Baker,因开发能够设计出在自然界从未见过的新型蛋白质的技术获得2020年科学突破奖生命科学奖。 今年 4月,成立仅一年的AI制药公司 Xaira Therapeutics 吸引到 10亿美元的单轮融资,成为今年生物医药领域金额最高的一笔融资,并吸引到前斯坦福校长 Marc Tessier-Lavigne 担任首席执行官。 他也因开发从头设计自然界从未出现的新型蛋白的技术,获得2020年科学突破奖生命科学奖。
智药邦
Science:神经回路有问题 合成蛋白来修复
近日,来自日本庆应义塾大学、牛津大学和德国神经退行性疾病中心的研究人员,在《Science》发表题为Asynthetic synaptic organizer protein restores glutamatergic neuronal circuits的研究论文,该研究中合成了一种新型的突触组织蛋白,可以有效修复或重塑神经元回路。
生物探索